Index
ورود کاربر
Telegram RSS ارسال به دوستان نسخه چاپی ذخیره خروجی XML خروجی متنی خروجی PDF
کد خبر : 164346
تاریخ انتشار : 18 مهر 1391 0:0
تعداد مشاهدات : 87

دكتر شاهزاده‌فاضلی، رئيس مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران

تعیین موقعیت فیلوژنیك و كنترل كیفیت توالی دی ان ای

محققان مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران موفق به ارائه دو دستاورد «تعيين موقعيت فيلوژنيك بر اساس جديدترين استاندارد بين المللي ARB» و «كنترل كيفيت توالي 16S rRNA بر اساس ويژگي هاي ساختار دوم و ساختارهاي حفاظت شده» براي نخستين بار در خاورميانه شدند...
علمي و فناوري - جهاد دانشگاهي: محققان مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران موفق به ارائه دو دستاورد «تعيين موقعيت فيلوژنيك بر اساس جديدترين استاندارد بين المللي ARB» و «كنترل كيفيت توالي 16S rRNA بر اساس ويژگي هاي ساختار دوم و ساختارهاي حفاظت شده» براي نخستين بار در خاورميانه شدند. دكتر سید ابوالحسن شاهزاده فاضلی، رئيس مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران در گفت وگو با خبرنگار علمي ايسنا درباره اين دو دستاورد جديد اظهار كرد: بنا بر اعلام كميته بين المللي سيستماتيك پروكاريوت ها، تعيين موقعيت فيلوژنيك يكي از الزامات شناسايي پلي فازيك ميكروارگانيسم هاست كه استفاده از سيستم ARB و پايگاه هاي داده SILVA و LTP به عنوان صحيح ترين روش رسم درخت فيلوژنيك از سوي اين كميته و به عنوان دقيق ترين روش بين المللي استاندارد معرفي شده است. وي افزود: اين سيستم از ويژگي هاي حفاظت شده توالي و ساختار ژن هاي ريبوزومي براي هم راستاسازي توالي ها و مشخص كردن موقعيت فيلوژنيك سويه استفاده مي كند كه براي نخستين بار در خاورميانه، در ايران به كار گرفته مي شود. شاهزاده فاضلي با اشاره به اين كه مجموعه نرم افزاري ARB با داشتن ابزارهاي مناسب و گروه هاي داده يي آن، در دنيا به عنوان روشي استاندارد براي آناليز داده هاي rRNA در حجم انبوه پذيرفته شده است، توضيح داد: نخستين مقاله اين پروژه در سال 2004 توسط Ludwing و همكاران او منتشر شده و تا كنون بيش از 2800 بار در انتشارات معتبر علمي رفرنس داده شده است. تعيين موقعيت فيلوژنيك» و «كنترل كيفيت توالي دي ان اي» در شناسايي ميكروارگانيسم ها رئيس مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران درباره ديگر دستاورد محققان اين مركز كه «کنترل کیفیت توالی 16S rRNA بر اساس ویژگی های ساختار دوم و ساختارهای حفاظت شده» است به خبرنگار ايسنا گفت: شرط اوليه صحيح بودن هر آناليز، صحت و دقت مناسب داده هاي ورودي آن است. خطاهاي ناشي از بدخوانش توالي هاي DNA در بسياري از موارد باعث برآورد نادرست از ارتباطات فيلوژنيك و حتي سرمايه گذاري مالي، علمي و زماني غير مفيد در شناسايي گونه هاي جديد ميكروبي مي شود. وي ادامه داد: در اين ارتباط از آخرين ويرايش هاي نرم افزار ARB (نوامبر 2011) و پايگاه هاي داده (جولاي 2012) مطابق با آخرين استانداردها استفاده مي شود تا خطاهاي خوانشي كه بر اساس ساختار دوم و يا ويژگي هاي حفاظت شده ساختاري در محصولات ژن هاي rRNA قابل رديابي هستند، شناسايي شوند. شاهزاده فاضلي تصريح كرد: ارائه اين دو دستاورد در حوزه شناسایی میکروارگانیسم ها، گام دیگری در قطع وابستگی به کشورهای خارجی و کمک به محققان داخلی است و مرکز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران آمادگی کامل دارد تا این دو دستاورد را به جامعه تحقیقاتی و محققان كشور ارائه كند.