Index
ورود کاربر
Telegram RSS ارسال به دوستان نسخه چاپی ذخیره خروجی XML خروجی متنی خروجی PDF
کد خبر : 178362
تاریخ انتشار : 11 خرداد 1394 0:0
تعداد مشاهدات : 18

سیستم جدید آنالیز میکروبی در کشور راه اندازی شد

مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران سیستم آنالیز میکروبی را به منظور دست یابی به تنوع میکروبی موجود در هر محیط راه اندازی کرد. به گزارش خبرگزاری مهر، سید ابوالحسن شاهزاده فاضلی، رئیس مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران در خصوص راه اندازی این تکنیک گفت: به منظور شناسایی ترکیب جامعه میکروبی تعداد زیادی از روش های بیوشیمیایی و مولکولی به کار برده می شود. روش های بررسی اکولوژی میکروبی به دو دسته روش های وابسته به کشت و روش های مستقل از کشت تقسیم می شوند. محدودیت عمده تکنیکهای وابسته به کشت این است که بیش از ۹۹ درصد میکروارگانیسم های موجود در هر محیط و قابل مشاهده به وسیله میکروسکوپ توسط تکنیکهای استاندارد، قابل کشت نیستند. وی افزود: بنابراین بخش عظیمی از اجتماع میکروبی موجود در طبیعت قابل کشت در آزمایشگاه نیست و در نتیجه منبع اولیه اطلاعات برای این میکروارگانیسم های غیر قابل کشت اما زنده، بیومولکول های آنها مانند اسیدهای نوکلئیک، لیپید و پروتئین های آنها است. رئیس مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران با بیان اینکه تکنیکهای بررسی مولکولی به منظور بررسی فیلوژنتیکی و تنوع متابولیکی میکروارگانیسم ها متاژنومیکس (Metagenomics) است، بیان کرد: . مفهوم متاژنومیکس که بر پایه استفاده از تکنولوژی و تکنیکهای نسل جدید توالی یابی استوار است، یکی از روش های بررسی کل اجتماع میکروبی است. متاژنومیکس به توالی یابی و آنالیز DNA استخراج شده به طور مستقیم از نمونه های محیطی بدون نیاز به کشت ارگانیسم های موجود در نمونه گفته می شود. فاضلی اظهار داشت: تحقیقات متاژنومیک را می توان در مورد محیط های مختلفی مانند خاک، فیلوسفر، بستر اقیانوس، آبهای دریاها و چشمه ها، معادن اسیدی، نواحی بسیار شور، نواحی بسیار داغ، بدن موجودات زنده و انواع محیط های حاوی جوامع میکروبی به کار برد و از نتایج آن در تهیه تنوع فیلوژنتیکی و تنوع متابولیکی و برای فهم نقش بیوشیمیایی میکروارگانیسم های غیر قابل کشت و برهم کنش آنها با دیگر فاکتورهای زیستی و غیر زیستی حیات استفاده کرد. وی تصریح کرد: تحقیقات متاژنومیکس علاوه بر استفاده از جدیدترین تکنولوژی های توالی یابی برای حصول اطلاعات ژنتیکی خام نیازمند دقیق ترین و جدیدترین روش های آنالیز بیوانفورماتیکی برای فرآوری و پالایش اطلاعات بسیار انبوه جوامع میکروبی نیز است. رئیس مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران افزود: مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران که رسالت خود را جمع آوری، شناسایی، حفظ و ذخیره و ارائه ذخایر ژنتیکی و زیستی می داند، پس از انجام موفقیت آمیز اولین پروژه توالی یابی کامل ژنوم های میکروارگانیسم های بومی ایران با در اولویت قرار دادن تحقیقات مبتنی بر متاژنومیکس و آنالیز متاژنومی محیط های مختلف میکروبی گام بلند دیگری را در جهت نیل به شناسایی و حفظ و بهره برداری از ذخایر ژنتیکی میکروبی ارزشمند این مرز و بوم برداشته است. وی با بیان اینکه در این راستا مرکز ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران موفق به استقرار و راه اندازی سیستم آنالیز کمی و فیلوژنتیکی داده های متاژنوم (QIIME) در کشور شده است، عنوان کرد: سیستم آنالیز QIIME که در سال ۲۰۱۰ و با چاپ در نشریه معتبر Nature methods به محققان و دانشمندان عرصه متاژنومیکس و ژنومیکس میکربی معرفی شد، با داشتن تعداد ارجاعات (Citation) فراوان از مقالات و تحقیقات معتبر و گوناگون به عنوان جدیدترین و معتبرترین روش آنالیز کمی جوامع میکروبی شناخته شده است. فاضلی گفت: با استفاده از این روش می توان به درستی به تنوع میکروبی موجود در هر محیط دست یافت و سطوح مختلف تنوع ژنتیکی آلفا و بتا را در چندین جامعه میکروبی به طور همزمان و مقایسه ای مورد مطالعه قرار داد. وی افزود: راه اندازی این روش علاوه بر این که راهگشای بررسی های متاژنومی مناطق مختلف در مرکز است، به عنوان یک خدمت بسیار تخصصی قابل ارائه به متقاضیان و محققان داخلی و خارجی است.